南方醫科大學前身為中國人民解放軍第一軍醫大學，創建于1951年，1979年被確定為全國重點大學，2004年8月整體移交廣東省，更名為南方醫科大學。學校是全國首批、廣東省唯一一所“部委省”共建高校，也是廣東省高水平大學“重點建設高校”。
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學校現有6所直屬附屬醫院，床位總數超過7000張。擁有國家臨床重點專科16個，國家中醫藥管理局重點學科6個、重點專科4個，廣東省“十二五”醫學重點學科7個，廣東省臨床重點專科54個，廣東省醫療質量控制中心4個，建成了廣東省腎臟病研究所、廣東省骨科研究院。南方醫院惠僑樓是全國首家、規模最大的涉外醫療中心，曾被中央軍委授予“模范醫療惠僑科”榮譽稱號，并得到江澤民同志親筆題詞嘉勉。
自20世紀80年代以來，學校開創了全國高校產學研一體化先河，以自主研發的“三九胃泰”、“正天丸”、“無限極口服液”、“尿毒清”等產品為基礎，先后創建了深圳南方制藥廠(三九集團前身)、南方李錦記營養保健品有限公司、廣州康臣藥業有限公司等國際知名的醫藥企業。研制出了國際上第一個 SARS抗原檢測試劑盒、第一臺國產“X-刀”、國家Ⅰ類新藥B超心臟造影劑、地中海貧血診斷試劑盒等高端科研產品并成功實現產業化。
